臭氧的另一個重要用途是用于水處理過程中。臭氧用于潔凈水、礦泉水、無鹽水的消毒殺菌時，可起到殺菌、除異味、增氧和改善口感的作用；用于游泳水凈化、中水回用、污水的處理時，可去除污水中難處理的化學物質，并有脫色，除異味功能；臭氧還可在循環冷卻水時，阻止水垢生成、緩解設備及管道腐蝕�？陀^地講，臭氧是一種、環保的殺菌劑。既然臭氧有如此多的優點，那為什么許多食品企業還不愿意購買使用臭氧發生器呢？認為，導致這種現狀的原因很多，不少企業誤認為“用臭氧殺菌的成本很高”，就是重要原因之一。

那么，用臭氧殺菌的成本是不是真的很高呢？事實并非如此，原因主要有：

       1、原料成本低。臭氧的原料來源充足，可以直接用空氣為原料，原料及原料處理幾乎不要花錢。

       2、操作簡單方便，在使用微電腦控制的臭氧發生器時，可以設定工作參數，無需人員值守，可減少人工費用。

       3、可減少健康費用的支出。自動化控制程度高，人員無需呆在消毒室，且臭氧發揮殺菌作用后，會很快分解，所以，用臭氧殺菌消毒，不會對操作人員的健康產生危害，不會引發象化學熏蒸劑消毒那樣的職業病。